V oddaljeni prihodnosti so v človeških možganih odkrili psionski hormon, ki ljudem omogoča nadnaravne sposobnosti, kar je spremenilo ves znani svet. Ko je človeštvo vstopilo v novo dobo, so se pojavili mutanti, imenovani Others, ki so lačni človeških možganov. Mutanti so zelo odporni proti običajnim konvencionalnim orožjem, zato so bili sprejeti posebni ukrepi za boj proti tej doslej nevideni grožnji človeštvu. Scarlet Nexus je čudovito stilizirana akcijska igra z izvirnim bojnim sistemom, polnim nadnaravnih sposobnosti.
Uporaba psihokinetičnih spretnosti je postala najmočnejše orožje po vsem svetu. Dvigovanje, razbijanje in metanje kosov okolja ter s tem ustvarjanje močnih napadov in kombinacij so edini načini, kako premagati močnega sovražnika.
Izprijeni mutanti, ki so se spustili z nebes, so zelo odporni na konvencionalne napade in obrambo ter so se odločili opustošiti svet. So v stalni agoniji, ki jo povzroča mutacija, zato iščejo možgane živih bitij, ki bi ukrotili njihovo norost. V tem futurističnem Japonsku se združuje navdih iz klasičnih anime in zahodnih znanstvenofantastičnih del v žanru, imenovanem Bran Punk.
V igri boste prevzeli vlogo Yuita Sumeragi iz enote Other Suppression Force (OSF). Postopoma boste osvojili svoj psihokinetični talent, raziskali futuristično mesto New Himuka in razkrili skrivnosti Brain Punk prihodnosti. Za zgodbo stojijo ljudje, ki so ustvarili igro Tales of Vesperia, zato se lahko veselite kompleksne zgodbe, polne poguma, junaštva in tudi medčloveških odnosov.