V Far Cry 3 se znajdete v koži Jasona Brodyja, moškega, ki sam stoji na robu sveta na skrivnostnem tropskem otoku, odrezanem od civilizacije. V tem brutalnem raju, kjer kriminal in nasilje predstavljata edino gotovost, boste odločali, kdaj in na kakšen način se bodo dogodki v igri odvijali.

Onkraj civilizacije se razprostira otok, kjer ne veljajo nobeni zakoni. To je kraj, ki mu vladata piratstvo in človeška beda, in od koder je izhod le prek drog ali krogle v glavo. In prav tu ste se znašli. Zaglavili ste tam, kjer se dobro ne loči od zla, na mestu, ki ga vodijo načela nasilja.