Crash Bandicoot: Mind Over Mutant nadaljuje igralsko in zgodbeno nit prejšnjega naslova Crash of the Titans. Spet boste obiskali otok Wumpa Island, ki pa ne bo več v obliki strogo ločenih lokacij, ki so delovale kot samostojne stopnje. Igralni svet bo sicer razdeljen na območja, vendar bodo ta prosto dostopna in posamezne naloge v njih boste opravljali postopoma, glede na to, kako boste pridobivali nove sposobnosti. Katerekoli misli, da bi se sam Crash lahko na kakršen koli način razvijal v okviru RPG sistema, pa vrzite za glavo. Te nove sposobnosti bo Crash pridobival v obliki obvladovanih mutantov, ki jih zdaj lahko skriva v domnevnem žepu, da jih nato ob pravem trenutku potegne ven in uporabi. Najprej pa mora vsakega mutanta obvladati, pri čemer bo ta proces deloval zelo podobno kot obvladovanje titanov v prejšnji igri. Kljub temu se bo v igri pojavilo nekaj povsem novih elementov. Sem sodi nabor novih gibov; Crash bo lahko plezal po stenah, kopal zemljo za bonuse in uporabljal nov sistem protinapadov in izogibnih manevrov. Prvič v seriji bo igra podpirala kooperacijo, pri čemer bo drugi igralec nadzoroval Crashovo sestro Coco, ki med drugim razpolaga s posebno sposobnostjo Treasure Hunt in le z njeno pomočjo boste dosegli zares posebne bonuse in zaklade.