Kljub vsem pričakovanjem to ni nadaljevanje Modern Warfare. Pravzaprav ne gre niti za vrnitev Ghosta kot priljubljenega lika iz prejšnjih del. Call of Duty: Ghosts je preprosto nova franšiza, ki naj bi prinesla povsem novo zgodbo.

Dogajanje igre se odvija 10 let po ogromni katastrofi, ki je uničujoče prizadela ZDA, zato te več ne bodo veljale za velesilo. Zgodba CoD: Ghosts nas popelje v skupino elitnih plačancev, znanih pod imenom Ghosts. Ti se borijo proti doslej največji grožnji.